Специалистом, само собой, не являюсь, пишу, ибо интересно...
Мне очень первая аппликатура по этой ссылке понравилась!
Та, которая Virdung's
А что, дудочку нереально вот так грамотно отстроить? Много будет неточностей?
Кстати, насколько я понимаю, в блокфлейту в C на самом деле должен быть "зашит" строй ре-мажор с двумя диезами, к которому снизу добавляется нота "до".